Los proyectos de investigación que se desarrollan en la UNISS responden a programas priorizados en consonancia con la producción de alimentos, la sustitución de importaciones, el empleo de energías renovables y el desarrollo local. 15 de ellos están asociados a Programas Nacionales, Sectoriales, Territoriales y Empresariales, y 25, a Programas Institucionales.